Родился в д. Торбеевка (ныне в черте р. п. Ромоданово Ромодановского района), в крестьянской семье. Летчик. Гвардии лейтенант. Русский. Член ВКП(б) с 1944 г. Окончил Саранский землеустроительный техникум в 1930 г., работал землемером в Ромоданове. В 1938 г. окончил Уральский политехнический институт, курсы летчиков-наблюдателей. Работал начальником смены и помощником начальника мартеновского цеха Алапаевского металлургического завода.
Участник Великой Отечественной войны с 1941 г. Штурман звена 9-го гвардейского минно-торпедного авиаполка Северного флота (5-я минно-торпедная авиационная дивизия) гвардии лейтенант М. П. Боронин к январю 1944 г. совершил 22 боевых вылета. Его экипаж потопил 2 транспорта и танкер врага, в группе – один транспорт и сторожевой корабль.
11 мая 1944 г. Боронин потопил крупный немецкий транспорт, но и сам был подбит и упал в море у берегов Норвегии.
Звание Героя Советского Союза присвоено 22 февраля 1944 г. Награжден орденами Ленина, двумя – Красного Знамени, Отечественной войны 2-й степени, медалями.
Памятник герою установлен в г. Алатырь Чувашской Республики. Бюст М. П. Боронина, в числе 53-х летчиков-североморцев, удостоенных звания Героя Советского Союза, установлен в пос. Сафоново на Аллее Героев около музея ВВС СФ. На здании мартеновского цеха в г. Алапаевске Свердловской области и на доме на родине установлены мемориальные доски. Имя героя носят теплоход и улица в пгт Ромоданово Республики Мордовия.